Penggunaan invois manual memerlukan masa yang lama, berisiko tinggi terhadap kesilapan manusia, dan menyukarkan pengurusan transaksi kewangan secara efisien.

Organisasi mungkin tidak memahami sepenuhnya bagaimana e-invoice berfungsi, menyebabkan penggunaan yang kurang efektif dan menghalang penerapan sistem tersebut.

Tanpa pemahaman yang jelas mengenai peraturan yang berkaitan dengan e-invoice, organisasi berisiko tidak mematuhi perundangan yang boleh menyebabkan denda atau masalah undang-undang.

Tanpa penggunaan sistem e-invoice yang betul, rekod kewangan mungkin tidak teratur dan sukar untuk diaudit, menyebabkan ketidaksempurnaan dalam pengurusan kewangan organisasi.

Tanpa pemahaman tentang strategi dan teknik untuk memastikan ketepatan data invois, kesilapan seperti invois salah atau tidak lengkap boleh berlaku, menjejaskan reputasi dan kewangan syarikat.

​Jika sistem e-invoice tidak digunakan dengan berkesan, pemantauan transaksi dan pelaporan invois menjadi lebih rumit, memerlukan lebih banyak masa dan usaha.